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我不認為圖5中顯示的EAS PRS表現足以證明該聲明,這似乎暗示目前最佳的EAS PRS模型達到或超過了最佳的EUR模型。由於這些PRSmix+ EAS PRS僅在363k + 80k的台灣TPMI樣本上進行訓練和調整,因此EUR PRS使用可比方法訓練,但使用更大的GWAS數據,仍然在同樣良好表型的EUR測試集上產生(更)好的表現。
例如,這個新的PRSmix+,TPMI訓練的EAS T2D PRS在TPMI中達到責任尺度R^2 = 8.5%(表S14),使用來自89k EAS T2D病例和325k EAS T2D對照的數據(表S1),而Herasight EUR T2D PRS使用由Suzuki等人發表的GWAS關聯訓練,來自254k EUR T2D病例 + 1.49m EUR T2D對照,在英國生物銀行中達到責任尺度R^2 = 20.7%(16.8, 24.8)[2]。(其他團隊也訓練了類似的高預測性EUR T2D PRS [3],超過了這裡設定的R^2 = 8.5%的閾值)。
但這並不是說通過將這個新的EAS GWAS與其他可用的EAS GWAS結合起來,無法訓練出大幅改進的EAS PRS!例如,來自非TPMI EAS來源的樣本有效大小的20%是由龐大的Suzuki等人的多祖先T2D GWAS貢獻的。
新的結果即將公布!

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