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Je ne pense pas que les performances des PRS EAS montrées dans la Figure 5 justifient encore cette affirmation, qui semble suggérer que les meilleurs modèles de PRS EAS disponibles répondent maintenant ou dépassent les meilleurs modèles EUR disponibles. Étant donné que ces PRS EAS PRSmix+ ont été entraînés et ajustés uniquement sur 363k + 80k échantillons TPMI taïwanais, il est toujours vrai que les PRS EUR entraînés avec des méthodes comparables mais avec des données GWAS beaucoup plus importantes donnent (beaucoup) de meilleures performances dans des ensembles de test EUR également bien phénotypés.
Par exemple, ce nouveau PRS EAS T2D entraîné avec TPMI PRSmix+ atteint un R^2 à l'échelle de la responsabilité de 8,5 % (Table.S14) en utilisant des données provenant de 89k cas EAS T2D et 325k témoins EAS T2D (Table.S1), tandis qu'un PRS T2D EUR Herasight entraîné en utilisant des associations GWAS publiées par Suzuki et al. [1] et dérivé de 254k cas EUR T2D + 1,49m témoins EUR T2D atteint un R^2 à l'échelle de la responsabilité de 20,7 % (16,8, 24,8) dans le UK Biobank [2]. (D'autres groupes ont également entraîné des PRS T2D EUR hautement prédictifs [3] dépassant le seuil de R^2 = 8,5 % fixé ici).
Mais cela ne veut pas dire que des PRS EAS considérablement améliorés ne peuvent pas être entraînés en combinant ce nouveau GWAS EAS avec d'autres GWAS EAS disponibles ! Par exemple, 20 % de la taille d'échantillon effective du massive GWAS T2D multi-ancestrale de Suzuki et al. est contribué par des sources EAS non-TPMI.
De nouveaux résultats à venir bientôt !

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