図5に示されているEAS PRSのパフォーマンスは、まだその声明を正当化するとは思いませんが、これは、利用可能な最高のEAS PRSモデルが現在、利用可能な最高のEURモデルに匹敵するか、それを上回っていることを示唆しているようです。これらのPRSmix+ EAS PRSは、363k + 80kの台湾のTPMIサンプルのみでトレーニングおよび調整されたため、同等の方法でトレーニングされたEUR PRSは、はるかに大きなGWASデータを使用して、同様に表現型が良好なEURテストセットで(はるかに)優れたパフォーマンスをもたらします。 たとえば、この新しいPRSmix+、TPMIでトレーニングされたEAS T2D PRSは、89k EAS T2Dケースと325k EAS T2Dコントロール(表S1)のデータを使用して、TPMIで責任スケールR^2 = 8.5%(表S14)を達成しますが、Suzukiら[1]によって公開され、254k EUR T2Dケース+ 1.49m EUR T2Dコントロールから導き出されたHerasight EUR T2D PRSは、責任スケールR^2 = 20.7%(16.8、 24.8) 英国バイオバンク [2]。(他のグループも同様に、ここで設定された R^2 = 8.5% しきい値を超える予測性の高い EUR T2D PRS [3] をトレーニングしています)。 しかし、この新しい EAS GWAS を他の利用可能な EAS GWAS と組み合わせても、大幅に改善された EAS PRS をトレーニングできないというわけではありません。たとえば、大規模な Suzuki et al. 多祖先 T2D GWAS の有効サンプル サイズの 20% は、非 TPMI EAS ソースによって寄与されています。 これに関する新しい結果は近日公開されます!