Usando uma combinação de falhas em Super Mario World, Yoshi pode ser levado para a batalha final, onde ele pode comer a Peach após a derrota do Bowser. Com a Peach desaparecida, o final não será reproduzido, e Mario e Yoshi simplesmente se encararão para sempre.
O salto na capacidade de armazenamento dos cartuchos da Nintendo 64 para os discos do GameCube permitiu que os desenvolvedores fossem incrivelmente generosos com o armazenamento em comparação. Uma cena cortada de Super Mario Sunshine, com uma única imagem a aparecer e desaparecer, é maior do que a totalidade de Super Mario 64.