Super Mario Bros. 3 містить дивний баг «мстивого Твомпа». Зазвичай, якщо Твомп отримує удар молотком, він просто гине. Однак, якщо діагональний Thwomp влучить у верхню точку, він виконає стрибок після смерті, щоб завдати останньої атаки помсти.

Використовуючи комбінацію глюків у Super Mario World, Йоші можна взяти у фінальну битву, де він з'їсть Піч після поразки Боузера. З відходом Піч фінал не відбудеться, і Маріо з Йоші просто дивитимуться один на одного вічно.

Стрибок у обсягі пам'яті з картриджів Nintendo 64 на диски GameCube дозволив розробникам бути надзвичайно щедрими у порівнянні з об'єктом. Кат-сцена Super Mario Sunshine, де одне зображення поступово з'являється і зникає, більша за весь Super Mario 64.