Durch die Kombination von Fehlern in Super Mario World kann Yoshi in den finalen Kampf mitgenommen werden, wo er Peach nach Bowsers Niederlage essen kann. Mit Peach verschwunden, wird das Ende nicht abgespielt, und Mario und Yoshi werden sich einfach für immer anstarren.
Der Sprung in der Speicherkapazität von Nintendo 64-Cartridges zu GameCube-Discs ermöglichte es den Entwicklern, im Vergleich dazu erstaunlich großzügig mit dem Speicher umzugehen. Eine Cutscene aus Super Mario Sunshine, in der ein einzelnes Bild ein- und ausgeblendet wird, ist größer als die gesamte Super Mario 64.